fix: mise 配置归属 dev 模块，更新 AGENTS.md 匹配当前结构

- 将 mise config.toml 从 base 移至 dev（包与配置同模块）
- AGENTS.md 仓库结构图更新为 modules/ 目录
- 验证命令改为遍历 modules/*.py
- 模块示例代码同步为当前写法

modules/dev.py

@@ -1,5 +1,5 @@
 import decman
-from decman import Module
+from decman import File, Module
 from decman.plugins.pacman import packages as pacman_packages
 
 BUN_GLOBAL_PACKAGES = [
@@ -17,6 +17,14 @@ class DevModule(Module):
         super().__init__("dev")
         self.user = user
 
+    def files(self):
+        return {
+            f"/home/{self.user}/.config/mise/config.toml": File(
+                source_file="./home/.config/mise/config.toml",
+                owner=self.user,
+            ),
+        }
+
     @pacman_packages
     def pacman_packages(self) -> set[str]:
         return {